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PR:CW: Referencia y punto

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[[Archivo:Metabolomics_schema.png|miniaturadeimagen|Esquema Metabólico ]]
El '''proteoma'''<ref name=OMS>{{Cita web |título= Proteoma |sitioweb= Descriptores en Ciencias de la Salud. Biblioteca Virtual en Salud. |url= https://decs.bvsalud.org/es/ths/resource/?id=34510&filter=ths_termall&q=proteoma |editor= OMS,OPS,BIREME}}</ref> es el conjunto de [[proteínas]] que se expresan o pueden expresarse a partir del [[genoma]] de una [[célula]], tejido u organismo, en un momento y condición determinada. El término se utilizó por primera vez en 1994 por [[Marc Wilkins]], para referirse al total de proteínas codificadas por un genoma<ref>{{Cita publicación|url=http://www.scientificamerican.com/article/proteins-rule/|título=Proteins Rule|apellidos=Ezzell|nombre=Carol|fecha=1 de abril de 2002|publicación=Scientific American|fechaacceso=19 de junio de 2016|doi=|pmid=}}</ref> y ha sido aplicado a diferentes escalas en los sistemas biológicos.

==Tipos de proteomas==
Generalmente el término ''proteoma'' se refiere a todas las proteínas de un organismo, pero existen organismos [[unicelulares]] y [[pluricelular]], que pueden tener proteomas muy diferentes en distintas células; de igual manera, ahora se pueden obtener todas las proteínas presentes en un organelo, a nivel sub-celular, por ello es importante distinguir los diferentes proteomas, sub-celular, celular, y completo.

* Un ''proteoma subcelular'' es el conjunto de proteínas que se encuentran en un determinado [[organelo]], de una determinada célula, por ejemplo, el proteoma [[Mitocondrial]] puede estar compuesto por más de 3000 diferentes proteínas.<ref>{{cite journal|url=https://journals.physiology.org/doi/full/10.1152/ajpcell.00108.2006|title=Tissue heterogeneity of the mammalian mitochondrial proteome|last1=Johnson|first1=D. T.|last2=Harris|first2=R. A.|date=2006|journal=American Journal of Physiology. Cell Physiology|volume=292|pages=c689-c697|fechaacceso=24 de septiembre de 2022|doi=10.1152/ajpcell.00108.2006|pmid=16928776|last3=French|first3=S.|last4=Blair|first4=P. V.|last5=You|first5=J.|last6=Bemis|first6=K. G.|last7=Wang|first7=M.|last8=Balaban|first8=R. S.}}</ref><ref>{{Cite journal|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5494306/|title=Definition of a High-Confidence Mitochondrial Proteome at Quantitative Scale|last1=Morgenstern|first1=Marcel|last2=Stiller|first2=Sebastian B.|date=Junio de 2017|journal=Cell Reports|volume=19|issue=13|pages=2836–2852|fechaacceso=24 de septiembre de 2022|issn=2211-1247|doi=10.1016/j.celrep.2017.06.014|pmc=5494306|pmid=28658629|last3=Lübbert|first3=Philipp|last4=Peikert|first4=Christian D.|last5=Dannenmaier|first5=Stefan|last6=Drepper|first6=Friedel|last7=Weill|first7=Uri|last8=Höß|first8=Philipp|last9=Feuerstein|first9=Reinhild|last10=Gebert|first10=Michael|last11=Bohnert|first11=Maria}}</ref><ref>{{cita publicación|url=https://www.hindawi.com/journals/omcl/2018/1435934/|título=Mitoproteomics: Tackling Mitochondrial Dysfunction in Human Disease|apellidos=Gómez-Serrano|nombre1=María|apellidos2=Camafeita|nombre2=Emilio|fecha=8 de noviembre de 2018|publicación=Oxidative Medicine and Cellular Longevity|volumen=2018|páginas=1–26|fechaacceso=24 de septiembre de 2022|doi=10.1155/2018/1435934|apellidos3=Loureiro|nombre3=Marta|apellidos4=Peral|nombre4=Belén}}</ref>

* Un ''proteoma celular'' es la colección de proteínas que se encuentran en un tipo de [[célula (biología)|célula]] particular, en una condición y momento específico.
* Un ''proteoma completo'' es aquel que hace referencia al conjunto de entero de proteínas que un organismo, ya sea [[unicelular]] o [[multicelular|pluricelular]], expresa a partir de su [[genoma]] completo. Esto es, a grandes rasgos, el equivalente proteíco del [[genoma]].
* Los [[virus]] tienen en su [[genoma]] secuencias que codifican a [[proteínas]] y se le conoce comúnmente como ''proteoma viral''. Estos proteomas generalmente son predichos a partir del [[genoma]] viral,<ref>{{cita publicación|url=https://genome.cshlp.org/content/14/10b/2029|título=From ORFeomes to Protein Interaction Maps in Viruses|apellidos=Uetz|nombre1=Peter|apellidos2=Rajagopala|nombre2=Seesandra V.|fecha=15 de octubre de 2004|publicación=Genome Research|volumen=14|número=10b|páginas=2029–2033|fechaacceso=24 de septiembre de 2022|doi=10.1101/gr.2583304|apellidos3=Dong|nombre3=Yu-An|apellidos4=Haas|nombre4=Jürgen}}</ref> aunque se han hecho algunos intentos para determinar todas las proteínas expresadas a partir del genoma de un virus, es decir, el proteoma viral.<ref>{{Cita publicación|url=https://journals.asm.org/doi/10.1128/MMBR.00042-06|título=Viral Proteomics|apellidos=Maxwell|nombre=Karen L.|apellidos2=Frappier|nombre2=Lori|fecha=Junio de 2007|publicación=Microbiology and Molecular Biology Reviews|volumen=71|número=2|páginas=398–411|fechaacceso=2022-09-24|idioma=en|issn=1092-2172|doi=10.1128/MMBR.00042-06|pmc=1899879|pmid=17554050}}</ref> Sin embargo, lo más frecuente es que la proteómica de los virus analice los cambios de las proteínas del huésped tras la infección del virus, de modo que en realidad se estudian "dos" proteomas (el del virus y el de su huésped).<ref>{{cita publicación|url=https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1586/14789450.4.6.815?journalCode=ieru20|título=Viral proteomics: global evaluation of viruses and their interaction with the host|apellidos=Viswanathan|nombre1=Kasinath|apellidos2=Früh|nombre2=Klaus|fecha=9 de enero de 2014|publicación=Expert Review of Proteomics|volumen=4|número=6|páginas=815–829|fechaacceso=24 de septiembre de 2022|doi=10.1586/14789450.4.6.815}}</ref>

== Proteómica ==
La '''[[proteómica]]''' es el estudio a gran escala de las proteínas.<ref>{{Cita publicación|url=http://doi.wiley.com/10.1002/elps.1150191103|título=Proteome and proteomics: New technologies, new concepts, and new words|apellidos=Anderson|nombre=N. Leigh|apellidos2=Anderson|nombre2=Norman G.|fecha=Agosto de 1998|publicación=Electrophoresis|volumen=19|número=11|páginas=1853–1861|fechaacceso=2020-11-20|idioma=en|issn=0173-0835|doi=10.1002/elps.1150191103}}</ref><ref>{{Cita publicación|url=https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0167779998012451|título=Proteomics: quantitative and physical mapping of cellular proteins|apellidos=Blackstock|nombre=Walter P|apellidos2=Weir|nombre2=Malcolm P|fecha=Marzo de 1999|publicación=Trends in Biotechnology|volumen=17|número=3|páginas=121–127|fechaacceso=2020-11-20|idioma=en|doi=10.1016/S0167-7799(98)01245-1}}</ref> La proteómica es un dominio interdisciplinario que se ha beneficiado enormemente de la información genética de varios proyectos del genoma, incluido el Proyecto del Genoma Humano.<ref>{{Cita publicación|url=http://genomemedicine.biomedcentral.com/articles/10.1186/gm483|título=The human genome project: big science transforms biology and medicine|apellidos=Hood|nombre=Leroy|apellidos2=Rowen|nombre2=Lee|fecha=2013|publicación=Genome Medicine|volumen=5|número=9|páginas=79|fechaacceso=2020-11-20|idioma=en|issn=1756-994X|doi=10.1186/gm483|pmc=4066586|pmid=24040834}}</ref> Cubre la exploración de proteomas a partir del nivel general de composición, estructura y actividad de las proteínas. Es un componente importante de la genómica funcional.
La proteómica generalmente se refiere al análisis experimental a gran escala de proteínas y proteomas, pero a menudo se usa específicamente para referirse a la purificación de proteínas y la espectrometría de masas.
Según varios científicos podemos resumir al proteoma con la realización de 3 actividades: identificar todas las proteínas elaboradas dentro de una célula en específico, tejido u organismo; determinar como estas proteínas forman redes similares a circuitos eléctricos dentro de los organismos; y por último, determinar las estructuras tridimensionales que adoptan estas proteínas.

==Historia==

El genetista australiano [[Marc Wilkins]] acuñó el término «proteoma» (''proteome''<ref>{{Cita publicación|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19929606|título=Proteomics data mining|apellidos=Wilkins|nombre=Marc|fecha=Diciembre de 2009|publicación=Expert Review of Proteomics|volumen=6|número=6|páginas=599–603|fechaacceso=2 de abril de 2018|issn=1744-8387|doi=10.1586/epr.09.81|pmid=19929606}}</ref>) en 1994, en un simposio sobre "2D Electrophoresis: from protein maps to genomes" [Electroforesis 2D: de los mapas de proteínas a los genomas], celebrado en Siena en Italia. Apareció impreso en 1995,<ref>{{Cita publicación|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/7498152|título=Progress with gene-product mapping of the Mollicutes: Mycoplasma genitalium|apellidos=Wasinger|nombre=V. C.|apellidos2=Cordwell|nombre2=S. J.|fecha=Julio de 1995|publicación=Electrophoresis|volumen=16|número=7|páginas=1090–1094|fechaacceso=2 de abril de 2018|issn=0173-0835|doi=10.1002/elps.11501601185|pmid=7498152|apellidos3=Cerpa-Poljak|nombre3=A.|apellidos4=Yan|nombre4=J. X.|apellidos5=Gooley|nombre5=A. A.|apellidos6=Wilkins|nombre6=M. R.|apellidos7=Duncan|nombre7=M. W.|apellidos8=Harris|nombre8=R.|apellidos9=Williams|nombre9=K. L.}}</ref> con la publicación de parte de la tesis doctoral de Wilkins. Wilkins utilizó el término para describir todo el conjunto de proteínas expresadas por un genoma, célula, tejido u organismo.

== Importancia ==

La importancia del estudio del proteoma a través de la [[proteómica]] radica en que a través de esta podemos comprender las interacciones que tienen las proteínas con un organismo.

Conocer el proteoma de un organismo nos ayuda por ejemplo para el desarrollo de medicinas mediante el estudio comparativo de las proteínas presentes en un organismo sano y uno enfermo (como sería en el caso del [[melanoma]]). Para poder desarrollar estos medicamentos se realizan los siguientes pasos:
# Hacer la [[electroforesis]] de muestras de tejido sano y compararlas con muestras de tejido cancerígeno, se podrá observar la presencia abundante de una proteína en el gel del tejido cancerígeno.
# Aislar dicha proteína mediante un proceso de cristalización.
# Realizar [[cristalografía de rayos X]] para que así podamos determinar su estructura.
# Una vez determinada la estructura de la proteína, se podrá diseñar un medicamento que actúe en el sitio activo de dicha proteína.

También se puede emplear para evitar medicamentos con efectos secundarios.

== Véase también ==
*[[Bioinformática]]
*[[Metaboloma]]
*[[Transcriptoma]]

==Referencias==
{{Listaref}}

==Enlaces externos==
* [http://www.thehpp.org/ The Human Proteome Project]
* [https://web.archive.org/web/20081122145613/http://bioinformatics.oupjournals.org// Bioinformatics Journal]
* [https://web.archive.org/web/20140312021627/http://pir.georgetown.edu/ PIR database]
* [http://www.uniprot.org/ UniProt database]
* [http://webarchive.loc.gov/all/20110506030957/http%3A//pfam.sanger.ac.uk/ Pfam database]
* [http://www.proteomesci.com/ Proteome Science]
* [http://www.proteomesoftware.com/ Proteome Software]
* [http://www.thegpm.org/ The Global Proteome Machine (GPM)]
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Proteoma - Historial de revisiones

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