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Diferencia entre revisiones de «Proteoarchaeota»
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| Proteoarchaeota | ||
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Archivo:RT8-4.jpg Arquea Sulfolobus infectada con virus STSV-1. | ||
| Taxonomía | ||
| Dominio: | Archaea | |
| (sin rango) |
Proteoarchaeota Petitjean et al. 2014 | |
| Filos | ||
Proteoarchaeota o Filarchaeota es un claro propuesto de arqueas antes llamado TACK, este último un acrónimo de Thaumarchaeota, Aigarchaeota, Crenarchaeota y Korarchaeota, los primeros grupos descubiertos.[1][2][3] Se encuentran en diferentes ambientes comprendiendo desde termófilos acidófilos hasta mesófilos y psicrófilos y con diferentes tipos de metabolismo. Comprende a las arqueas con características más parecidas a los eucariotas.
Este grupo está relacionado con el origen del primer ser eucariota, el análisis comparativo genómico ha revelado que codifican varias proteínas que se creían únicas de los eucariotas como la actina (microfilamento del citoesqueleto, implicado en la motilidad celular), la tubulina (componente del citoesqueleto mayor, microtúbulo), el sistema de ubicuitina (degradación y reciclaje de proteínas) y los complejos de clasificación endosómica, necesarios para el transporte de membrana (ESCRT III), implicados en la división celular.[4]
Clasificación
Se ha establecido que Proteoarchaeota se divide en dos clados que a su vez constituyen dos supergrupos.
- Thermoproteota o TACK. Son las arqueas más abundantes en el ecosistema marino, especialmente en las profundidades y en sedimentos, incluso con escasez de nutrientes. Comprende organismos que van desde hábitat fríos (psicrófilos) a los más calientes (hipertermófilos) de los ambientes geotermales, tanto terrestres como marinos. Mayoritariamente son anaerobios, quimiosintéticos e importantes en el ciclo del carbono y del nitrógeno.
- Promethearchaeota o Asgard. Pequeño grupo probablemente psicrófilo encontrado en sedimentos que presenta las características arqueanas compartidas con los eucariontes que previamente se conocían distribuidas entre diferentes grupos de arqueas.[5]
Filogenia
La unidad filogenética de este grupo está consensuada, así como su relación con los eucariontes (hipótesis del eocito). Actualmente se considera que Proteoarchaeota es un clado que incluye a las arqueas Asgard.[6] Por otra parte, Cavalier-Smith nombra a este grupo como Filarchaeota.[7] Sus relaciones son aproximadamente las siguientes:[8][9][10]
| Proteoarchaeota |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Referencias
- ↑ Castelle, C. J., Wrighton, K. C., Thomas, B. C., Hug, L. A., Brown, C. T., Wilkins, M. J., ... & Taylor, R. C. (2015). Genomic expansion of domain archaea highlights roles for organisms from new phyla in anaerobic carbon cycling. Current Biology, 25(6), 690-701.
- ↑ Céline Petitjean et al 2014. Rooting the Domain Archaea by Phylogenomic Analysis Supports the Foundation of the New Kingdom Proteoarchaeota Genome Biol Evol (2014) doi: 10.1093/gbe/evu274
- ↑ Ruggiero MA, Gordon DP, Orrell TM, Bailly N, Bourgoin T, et al. (2015) A Higher Level Classification of All Living Organisms. PLoS ONE 10(6): e0130114. doi: 10.1371/journal.pone.0130114
- ↑ Anja Spang et al. 2015. Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes. Nature 521, 173–179 (14 May 2015) doi:10.1038/nature14447
- ↑ Dey, G., Thattai, M., & Baum, B. (2016). On the Archaeal Origins of Eukaryotes and the Challenges of Inferring Phenotype from Genotype. Trends in Cell Biology, 26(7), 476-485.
- ↑ Eugene V. Koonin 2015, Archaeal ancestors of eukaryotes: not so elusive any more. BMC Biol. 2015; 13: 84. doi: 10.1186/s12915-015-0194-5 PMCID: PMC4594999
- ↑ Thomas Cavalier-Smith & Ema E-Yung Chao (2020). Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (eukaryotes, archaebacteria). Linkspringer.
- ↑ Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). «AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life». Nucleic Acids Research 47 (9): 4442-4448. PMC 6511854. PMID 31081040. doi:10.1093/nar/gkz246. Archivado desde el original el 23 de abril de 2021. Consultado el 21 de julio de 2021.
- ↑ «GTDB release 05-RS95». Genome Taxonomy Database.
- ↑ Jiarui Sun, Paul N. Evans, Emma J. Gagen, Ben J. Woodcroft, Brian P. Hedlund, Tanja Woyke, Philip Hugenholtz (2021). Recoding of stop codons expands the metabolic potential of two novel Asgardarchaeota lineages. Nature.
